为实现新医保信息系统与政策实现有序衔接，深圳市社保局多措并举，确保新医保信息系统已于2014年1月5日早上6：00正式上线运行。
1：加班备战，跟踪落实。为确保新医保信息系统上线运行后平稳过渡，信息中心和市社保局部分处室及分局工作人员元月4、5日利用周末双休时间，跟踪全市各定点医疗机构刷卡记账情况，并对新医保信息系统征收台账进行测试。截至目前新医保信息运行平稳。
2：制订方案，分步实施。为尽量减少给参保人就医刷卡带来的不便，信息中心分步组织实施新医保信息系统上线运行。第一步：即在1月2日至3日期间，先行暂停社保系统的部分业务，为新医保信息系统上线赢得时间，同时要求各业务处室，各分局做好对参保企业和参保人的解释工作;第二步：即在1月4日18：00至1月5日6：00期间，全市医保系统停用，将原有的信息数据导入新系统，确保新系统正式上线运行。
3：统一部署，协调合力。市社保局曾思克局长分别于2013年12月30日、2014年元月2日召开协调会。市人社局李滔副局长，市人社局信息中心，市社保局办公室、综合、计财、征收、养老、医保、工伤、失业处相关负责人参会。会上要求，各单位要高度重视，提前做好医保新信息系统上线的应急预案，并各司其职、齐心协力做好各项准备工作。
4：加强宣传，检查落实。市社保局通过在电台、报刊、微博及网站提前发布停机公告，同时要求全市各定点医疗机构张贴停机公告。市社保局医保工作人员还分赴各定点医疗机构检查落实情况，并要求各定点医疗机构在医保(含工伤医疗记帐)信息系统暂停记账功能期间，做好对参保人的解释工作，并提醒参保人先行现金支付医疗费用，待停机结束后，到所就医的定点医疗机构按规定办理补记帐和退款手续。