挂钩办法主要内容是：
（一）乡镇医院基本公共卫生工作考核季度分值在90分以上的按新农合结算比例的100%进行结算；80-89分的分别按新农合结算比例的90%进行结算；低于80分的按相应的百分比进行结算。
（二）次季度考核中，对上一季度存在问题整改实行百分制评价，次季度考核分值在90分以上且整改得分95分以上，奖励上一季度新农合结算扣减资金100%（或累计被扣的80%）；整改得分在85-95分的，奖励上一季度新农合结算扣减资金的85-95%（或累计被扣的60%）；整改得分在80-85分的，奖励上一季度新农合结算扣减资金的80%-85%（或累计被扣的40%），整改得分低于80分，不得奖励。次季度考核分值低于90分的不返还被扣减资金。
（三）结算采取季度考核、次季度结算的方式进行。因医疗机构工作得力，在省基本公共卫生服务考核工作中得到省级肯定的（如果医疗机构承担单项工作且得满分的视为得到省级肯定），奖励上一年度被扣总额（或累计被扣的80%）；因医疗机构工作不力影响我市考核结果的，次年全年新农合补偿款按考核比例再下调5%。